OBWE stanowi płaszczyznę współpracy, wymiany informacji i doświadczeń na rzecz ulepszania rozwiązań instytucjonalnych dot. zwalczania terroryzmu, poszerzania bazy prawnej i implementacji dokumentów międzynarodowych dot. walki z  terroryzmem. Kwestie terroryzmu stały się jednym z istotniejszych elementów działalności OBWE po 11 września 2001 r. Na sesji Rady Ministerialnej w 2001 r. przyjęto Bukareszteński Plan Działania na Rzecz Walki z Terroryzmem - The Bucharest Plan of Action for Combating Terrorism, następnie na X. posiedzeniu Rady Ministerialnej w Porto w 2002 r. przyjęto Kartę OBWE poświęconą zapobieganiu i zwalczaniu terroryzmu - OSCE Charter on Preventing and Combating Terrorism. Przy realizacji programów i projektów poświęconych walce z terroryzmem OBWE współpracuje m.in. z ONZ, UE i Radą Europy. OBWE poświęca dużo uwagi problemom walki z przestępczością finansową i finansowaniem terroryzmu.

Pod koniec 2002 r. w ramach Sekretariatu OBWE zaczęła działać komórka zajmująca się walką z terroryzmem: Zespół ds. Działań Przeciwko Terroryzmowi - Action against Terrorism Unit (ATU). Aktywność Zespołu koncentruje się na wypracowywaniu decyzji i deklaracji Rady Ministerialnej i Stałej Rady OBWE. Większość dokumentów ma charakter uzupełniający w stosunku do uregulowań i zaleceń innych instytucji międzynarodowych. Obszary działalności ATU określa Plan Działania, przewidujący m.in.  utrzymanie efektywnej i skutecznej roli OBWE w zwalczaniu terroryzmu, poszerzanie możliwości pomocy dla państw członkowskich oraz polepszanie koordynacji działań instytucji krajowych i międzynarodowych dot. przeciwdziałania i zwalczania terroryzmu. Działalność ATU koncentrowała się na następujących obszarach związanych z walką z terroryzmem: ochrona dokumentów podróży, partnerstwo publiczno-prywatne, ekstremizm i radykalizacja prowadzące do terroryzmu, ochrona infrastruktury krytycznej w sektorze energetycznym, cyberterroryzm.

Od 1998 r. na mocy decyzji Forum Współpracy w Dziedzinie Bezpieczeństwa - Forum for Security Co-operation (FSC) postanowiono dokonywać corocznej wymiany informacji w formie kwestionariusza na temat implementacji postanowień Kodeksu postępowania w polityczno-militarnych aspektach bezpieczeństwa (The Code of Conduct on Politico-Military Aspects of Security -  przyjęty 3 grudnia 1994 r.). Pierwsza część kwestionariusza dotyczy „Działań podjętych celem zapobiegania terroryzmowi, a w szczególności uczestnictwa w porozumieniach międzynarodowych dotyczących tej tematyki”. Polska corocznie dokonuje aktualizacji kwestionariusza.

OBWE i kraje członkowskie podkreślają znaczenie wymiaru ludzkiego oraz ochrony praw człowieka i podstawowych wolności w kontekście walki z terroryzmem. Problematyka ta leży w kompetencji Biura Instytucji Demokratycznych i Praw Człowieka (Office for Democratic Institutions and Human Rights - ODIHR).

W 2003 r. w ODIHR został utworzony Departament Praw Człowieka. Uwaga ODIHR koncentruje się na każdym etapie zwalczania terroryzmu pod kątem ochrony praw człowieka począwszy od zapobiegania i ścigania po dochodzenie i karanie. Od 2005 r. ODIHR jest zaangażowany w przedsięwzięcia służące umacnianiu zdolności poszczególnych państw w zakresie ochrony praw człowieka w kontekście zwalczania terroryzmu poprzez organizację szkoleń dla przedstawicieli władz i służb  państwowych oraz udział w programach pomocy technicznej, także we współpracy z innymi organizacjami i instytucjami międzynarodowymi (m.in. Radą Europy, Komisją Europejska, UNODC, Wysokim Komisarzem Praw Człowieka ONZ). Obszary zainteresowania ODIHR obejmują m.in. pomoc techniczną dla krajów OBWE w opracowywaniu projektów i ulepszaniu istniejącego prawa antyterrorystycznego, wsparcie na rzecz implementacji właściwych konwencji, protokółów i rezolucji ONZ, analizę ustawodawstwa antyterrorystycznego poszczególnych państw i jego wpływu na prawa człowieka, projekty dot. przeciwdziałania i zwalczania terroryzmu, projekty dot. promocji praw człowieka, tolerancji i wielokulturowości, projekty dot. zapobiegania konfliktów i pokojowego ich rozwiązywania, analizę źródeł terroryzmu i ich eliminację, współpracę z organizacjami praw człowieka, monitoring wydarzeń związanych z walką z terroryzmem. W 2007 r. ODIHR wydał przewodnik pn. Counter Terrorism, Protecting Human Rights.